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不过，在近几年，葡萄牙人却连续遭到严重的外部挑战。
首先就是日本幕府越来越严格的宗教排他法令，在将西班牙人逐出日本后，便要求葡萄牙人也要禁止在日本境内传教行为，更不得对日本国内的天主教徒施以救助和物资支持，否则将会像西班牙人一样，把他们葡萄牙人也排除在日本贸易市场之外。
然而，那些来到东方的传教士们都拥有狂热的宗教信仰，将日本境内的天主教徒视为他们的教众兄弟，不顾日本禁令和蚝镜官方的善意告知，频频潜入日本境内，对那些受到迫害的信徒予以心理上和物质上的支持。
在这种情势下，葡日关系逐渐变得有些岌岌可危，繁荣的对日贸易也屡遭重创。
三年前（1626年），蚝镜还有五艘商船驶往长崎，带回大量的白银。
而两年前（1627年），蚝镜却没有派出一艘船前往日本进行贸易。
当然，那一年，荷兰东印度公司大举围攻蚝镜，封锁珠江口长达数月，使得蚝镜的葡萄牙人无法出港贸易。
但是，在8月18日，葡萄牙人趁夜派出五艘桨帆船成功偷袭了荷兰东印度公司战船，占领并焚毁其中一艘，迫得荷兰人不得不再一次铩羽而归。
随后，葡萄牙人便立即组织了两艘商船前往日本长崎，但被幕府政府以“错时”为由拒绝他们入港贸易，最终只能空手而返。
在去年，葡萄牙按照幕府的规定贸易时间，派出了六艘商船进抵长崎，但却因在船上发现了伪装成水手的传教士，遭到日本当地政府的拒绝入港禁令。
虽然，经过一番申诉，最终勉强让长崎港的官员获准两艘商船靠岸交易。
但是，其他四艘商船则无奈地将货物拉回蚝镜，使得众多商人损失惨重。
而更让葡萄牙人惊惧的是，随着荷兰人在福尔摩沙岛站稳脚跟后，便以此为据点，开始频繁拦截和袭击途径这片海域的葡萄牙商船，严重威胁葡日之间的贸易。
除此之外，荷兰人凭借其愈发强大的东方海上力量，不断封锁并攻击果阿、锡兰以及马六甲等葡属东方殖民据点，隐然要彻底斩断他们葡萄牙人花费百年时间才建立的东方贸易链条。
面对越来越严峻的外部环境下，总督德·菲利普·罗保不得不召集议事会，将蚝镜的主教、市政官员以及众多贸易商人唤来，商讨如何应对。
除了主教曼努埃尔·费尔南德斯仍旧力主坚持要对日本境内的天主教徒施以
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