海瑞命令巡抚标营上前，要驱散这些武僧，进入山门，不料这些武僧都是精于武艺的，海瑞的巡抚标营和陆绎的锦衣校尉都没有装备大量的甲胄，又只有佩刀等短兵，没有长兵，在和这些武僧的交手中讨不到便宜。
海瑞铩羽而归，一面奏报朱载坖，称少林寺豢养私兵，对抗天威，请求朱载坖发兵镇压，另一面传檄新任镇守河南总兵官丰城侯李寰，命令调集精锐官军，立即赶赴登封，准备剿灭叛逆。
而正道等人也向朱载坖上疏，称少林寺绝无反心，但是海瑞不分青红皂白就要入寺拿人，历朝以来，断无此事，请求朱载坖另遣官员，详查此事。
朱载坖收到奏疏之后，立即要求镇守河南总兵官丰城侯李寰听巡抚海瑞节制。