核就更加严格，对于地方州县衙门，朝廷要按照地方年初所制定的预算，对地方官府予以考成，不能按照年初制定的计划完成的，没有特殊原因，一律要予以严惩。
而对于张居正来说，最重要的就是扩大一条鞭法和摊丁入亩的使用范围，在浙直和北方的试行已经说明一条鞭法和摊丁入亩是完全行得通的，所以张居正向朱载坖要求推广一条鞭法和摊丁入亩，朱载坖也同意了张居正的上疏，下诏继续扩大一条鞭法和摊丁入亩的试行范围，在南方各省，只要完成了田亩和人丁的清查的，都可以施行一条鞭法和摊丁入亩。
而在北方，朱载坖则相对比较保守，在山西等地先试行徭役折色和摊丁入亩，但是田赋仍旧不动，实征本色，主要用于朝廷的各种仓储，九边的军储等，没有立即将田赋也折色了。
这是朱载坖和张居正、鄢懋卿等人藩府讨论过后所决定的，因为南方经济比较发达，民间的银钱、制钱也比较多，而且距离京师远，无论怎么说，折色对于朝廷和百姓来说都是很方便的，但是北方经济相对落后，而且北方要承担九边军储的重任，朱载坖认为还是要征收本色，以充实仓储。
同时朱载坖还是再三严令，第一，将朝廷每年四百万石的漕粮增加到八百万石，其中四百万石是以本色形式征收，另外四百万石司农寺以朝廷制定的最低收购价予以征收；第二，就是各地官府不得全征折色，最低也要征收三成本色，用于存储了备荒、常平等仓库中，以保证朝廷有物资应对可能出现的灾荒和临时用兵等事情。
朱载坖还批准了支持河南、陕西、湖广等地的水利工程的计划，还有河套的水利工程也要由朝廷予以支持，使得河套成为朝廷在西北的重要产粮区。
还有辽东和大宁的马政，也是朱载坖非常之关心的事情，现在经过驸马都尉太仆少卿李和在辽东的经营，朝廷在辽东的行太仆寺所牧养的战马已经超过五万匹，除了可以满足辽东、大宁等镇官军的需求之外，还可以向京营和亲军诸卫提供马匹，现在官军所使用的由西域马河辽东杂交的战马，在马力和冲刺能力上已经超过了蒙古人的蒙古人。
朱载坖命令李和，继续加大在辽东套放牧马匹的数量，对于大宁都司、辽东都司的一些卫所，由于地理条件的限制，并不适合开垦，当地的卫所士卒就负责为太仆寺牧养战马，由朝廷调拨马草豆料和士卒的军饷粮秣
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