对于在刘綎的指挥下，官军迅速进剿，朱载坖还特地颁布上谕，在讨平倭乱之战中立功最大的土司，朱载坖会任命他为倭奴都统使司都统使同知，这点对于这些土司们的诱惑力还是很大的，因为对于现在的倭奴都统使司来说，所谓的都统司年纪尚小，而且在大明的严厉控制之下，是不可能履行什么都统使的职务的，而同知显然就是已经是都统使司的长官了，要是能够当上这个都统同知，就相当于成为倭国土司的长官了，虽然比不上之前的倭王权势重，但是依旧有很大的权力，所以不少有实力的土司也想要争取这个同知的地位。
同时官军大举扫荡，对于这些反叛的倭国土司，刘綎的态度是很明确的，就是破城杀人，杀到他们胆寒为止。虽然对于刘綎的举动，也有一些言官上疏弹劾，认为刘綎杀戮过重，但是朱载坖一概予以留中，根本不予理睬，同时还密旨给刘綎，要他大张挞伐，以彰天威，刘綎自然是心领神会，指挥官军大开杀戒。
而在辽东，朝廷虽然调集了重兵，但是却并没有发动攻势，将努尔哈赤部包围起来之后，官军逐步推进，稳扎稳打，在切断努尔哈赤的物资供应渠道之后，辽东地方官府开始将这些内附的女真人迁移到西北去，按照之前朝廷所设定的方案，对于这些蒙古人，朝廷要采取集中安置与分散安排相结合的办法予以安置。
所谓集中安置，就是以部族作为单位集中安排，在西北临边之地重新建立建州卫、建州左卫和建州右卫，发挥女真人为大明屏障的作用，而同时为了防止女真人做大之后反而威胁大明，朝廷还是要将这三卫予以分开安置，同时由官军加以监控，这样的话，既让女真人发挥大明藩篱的作用，又要防止这些女真成为大明的祸患，这点是极为重要的。
而一些不愿迁移的女真人则是投靠了努尔哈赤，最开始努尔哈赤是极为高兴的，因为的实力一下子从不过万余人扩张到了三万五千余精壮，使得努尔哈赤的实力现在比之以前提高了数倍，但是很快努尔哈赤就笑不出来了，因为这些几万张嘴是要吃饭的，尤其是这些所谓的精壮，他们要能够保持战斗力，是需要粮秣食品的。
而现在官军严密封锁各处道路，别说粮食这种大宗物资，就是食盐现在努尔哈赤都极为短缺，但是官军虽然聚集了大军，但是张元功和严绍庭谨守营垒，控制各条交通要道，却并不进攻，努尔哈赤当然很清楚官
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