多居住在果阿的本地人都被传教士强迫改信基督教。成千上万的居民为了逃避质问和侵扰，都纷纷移居邻近的卡纳塔克邦门格洛尔和卡尔瓦。同时投入巨资将此地打造成为他们窥视南洋的据点，这是朱载坖所不能容忍的。
卧榻之侧，岂容他人鼾睡，朱载坖这人一向比较护食，南洋已经被朱载坖视为自己的地盘了，谁窥视南洋，就等同于窥视大明，不打你打谁？再加上佛郎机鼓励与本地妇女通婚，在果阿定居，成为农夫、商贩或工匠。这些已婚男子很快成为特权等级，果阿也因此拥有相当数量的欧亚混血儿人口，随时可以拉起一支规模不小的军队，这是朱载坖所不能容忍的。