的控制，官军各军驻扎在大明的各处战略要地和边防重镇，同时这次大明的整个北部边疆防务也进行了大规模的调整，以前大明在北部边疆设立军镇作为防区，但是军镇的配置并不合理，最典型的就是山西，山西仅有一省，但是最多的时候宣府、大同、山西三镇，还有万全都司等边防机构，对于山西百姓的压力是极大的。
在经过朝廷的军事体制改革之后，山西仅剩一个镇守山西总兵官，统辖整个山西布政使司的边防事务，原来的万全都司和大同、宣府等镇都予以撤销，归入镇守山西总兵官麾下管理，各卫所为全部归入山西都司管理，而对于沿边堡垒，朝廷配置了大同、万全等分守参将各统帅一个师分守自己的信地，镇守总兵官麾下也有相应的机动兵力。
同时在山西、开平、东胜等地设立云翼军，下辖三个骑兵师和相应的配属部队，作为朝廷布置在这里的机动力量，直接保证大明外边和内边的安全，按照朱载坖的规定，在北方组建了机动力强的骑兵军屯驻在各个战略要地，作为朝廷威慑北虏，加强边防的机动力量，这点是极为重要的。
按照朱载坖的命令，还组建了骑炮兵，配属给各骑兵师加强他们的火力，骑马炮兵及其军官都骑马作战。每名骑马炮兵配备一把轻骑兵军刀和两把手枪，这些手枪固定在马鞍的羊皮覆盖物下。相比于普通的炮兵，骑炮兵的机动性更强，因为在和北虏作战之中，官军发现敌军骑兵往往会先于他占据阵地前方的高地，从而阻碍了他的侦察行动。为了更有效地驱逐敌军骑兵并夺回高地，朱载坖决定让炮群人员乘马行进，并跟随前卫部队或另一支强大的骑兵部队一同作战。
这些骑炮兵可以跟随官军骑兵机动作战，炮车等也经过了专门的加固，以保证能够适应骑兵的奔袭，这些骑炮兵以团为单位，配属在骑兵师中，除了京军中有一个骑兵军之外，朝廷还要组建四个骑兵军，其中三个部署在北方，用于震慑北虏，一个部署在开封，作为朝廷在中原的机动力量。
而剩余的各个步兵军，则是配置在朝廷各战略要地上，同时将南京京营和中都留守司合并，成立天武军，驻节南京，湖广的机兵和兴都留守司合并，成立虎翼军，驻节武汉，广州、缅甸、倭国等大明的战略要地也要驻守重兵，以守卫大明的国土。
不过令很多人不解的就是，这这次的官军编制调整中，水师也获得了两个军的编制
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