太子领命之后，自然是和内阁商量此事的，现在各个部院甚至是地方官府也都纷纷向朝廷请求追加拨款，朝廷自然是不可能对于他们的所有要求都予以满足的，这点大家都是很清楚的，朝廷的钱粮是有限的，所以哪些钱要给，哪些钱少给，哪些钱不能给，这就是内阁的职能了。
朱载坖将此事交给了太子，由太子领导内阁，太子自然是要召集内阁辅臣们商量此事了，对于各个部院衙门的上疏，内阁肯定是充分的讨论的，哪些部院的钱是要给的，这些都是内阁要商量的事情，太子询问道：“元辅和诸位先生们可有成算？”
对于太子的这个问题，申时行还是有些答案的，申时行说道：“殿下，臣以为此事当内阁诸位一道商量，然后付之公论可也。”
申时行提议内阁各位辅臣按照自己所分管的相应衙门，逐一进行讨论，对于这点，也得到了其他的内阁辅臣们的赞同，现在争议比较大的就是工部的相关追加预算案，一来就是工部所追加的预算规模十分之庞大，总数近六千万，即便是分十年投入，每年的投入也达到了六百万之巨，同时工部所拟定的一系列发展交通，扩建国营工场的相关计划，规模确实是十分之庞大的。
都察院和户部对此反对意见还是比较大的，首先就是工部所拟定的这些改善交通的计划，主要包括三个方面，第一是桥梁等基础设施的建设，第二就是直道的继续延伸，第三就是铁路的修建，规模都十分的浩大，其中耗资最大的就是各种桥梁的营建，除了应天府的长江大桥之外，还有兰州府的黄河桥，也是极为重要的工程，耗资也绝对不小，这些桥梁的建设周期很长，都察院认为耗资太大。
但是工部认为，只有打通这些关键的节点，才能够使得朝廷的直道真正的发挥作用，同时为了保证这些桥梁的顺利修建，朝廷还要大规模的扩建各种工场，主要就是钢铁工业，还有就是从民间大量的采购水泥等物资，这些也遭到了都察院和户部的反对，他们认为朝廷有自己的工场，为什么不扩建工场，加大对于水泥等其他建材的生产，而是要从民间采购。
对于这点，工部援引的是朱载坖的鼓励工商诏书，对于朝廷不禁榷的物资，朱载坖一向是鼓励从民间采购的，这丫那个可以促进地方经济的发展，同时使得朝廷赋税等也得以增加，所以工部认为，除了朝廷所禁榷的钢材之外，其余的物料都向民间采购，由商人
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