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唐朝建立后，孙思邈开始接受朝廷的邀请，与政府合作开展医学活动。
公元659年完成了世界上第一部国家药典《唐新本草》。公元682年孙思邈无疾而终。
《旧唐书》提到孙思邈“自注《老子》、《庄子》”，两书唐宋以来史志书目皆无著录，久已失传，故其关于道家思想的主张不得而知，唯蒙文通先生《晋唐老子古注四十家辑存》据赵秉文《老子集解》第六章“谷神不死”句，得孙思邈注佚文一条：“谷神，虚而灵者也”。
孙思邈是中华医学发展先河中一颗璀璨夺目的明珠，在中外医学史上留下不可磨灭的功勋，千余年来一直受到人们的高度评价和崇拜。唐太宗李世民赞孙思邈“凿开径路，名魁大医。羽翼三圣，调合四时。降龙伏虎，拯衰救危。巍巍堂堂，百代之师”。此颂元代勒石，当系后人附会之辞。
宋徽宗敕封孙思邈为“妙应真人”，被后世尊称为“药王”。
《千金要方》是我国最早的医学百科全书，从基础理论到临床各科，理、法、方、药齐备。一类是典籍资料，一类是民间单方验方。
广泛吸收各方面之长，雅俗共赏，缓急相宜，时至今日。很多内容仍起着指导作用，有极高的学术价值，确实是价值千金的中医瑰宝。
《千金要方》是对方剂学发展的巨大贡献。书中收集了从张仲景时代直至孙思邈的临床经验，历数百年的方剂成就，在阅读仲景书方后，再读《千金方》，真能大开眼界，拓宽思路，特别是源流各异的方剂用药，显示出孙思邈的博极医源和精湛医技。
后人称《千金方》为“方书之祖”。孙思邈是古今医德医术堪称一流的名家，尤其对医德的强调，为后世的习医、业医者传为佳话。
他的名著《千金方》中，也把“大医精诚”的医德规范放在了极其重要的位置上来专门立题，重点讨论。而他本人，也是以德养性、以德养身、德艺双馨的代表人物之一，成为历代医家和百姓尊崇备至的伟大医学人物。