地方的三司分权的后果就是地方互相推诿扯皮，难以完成朝廷的任务，所以从天顺之后，在边疆发生战事的时候，朝廷就不得不向地方临时派出大员来统领三司，也就是所谓巡抚，而为了加重巡抚的权力，使得巡抚能够能够统御地方三司，朝廷只能够向地方派出高级言官。
因为这些都察院的高级言官，手握监察大权，能够对于这些地方官员形成强大的压力，才能够更好的解决朝廷对于地方的控制问题，因为“巡抚”者，代天子巡行安抚地方之临时差使也。其全称是“巡抚某地方都察院副都御史（或佥都御史）”，有时还加兵部侍郎衔，俗称“部院”。
这个名称就凸显了巡抚的中央特派性质，从官制上来说，巡抚并非地方官员，而是朝廷的部院大臣，仅仅是临时有事呗派遣到地方处理地方的事情的，早期的巡抚也确实是事毕即还，并不是什么固定差遣。但是现在不仅仅是巡抚还有总督，都从朝廷的临时钦差变成了地方的督抚大员，但是他们仍旧具有朝廷中央部院大臣的特征。
如巡抚是都察院右佥都御史，总督是都察院右副都御史，他们都是高级言官，能够对于对于地方三司形成强大的压力，所以才能够统御地方三司和府州县，但是朝廷也很快发现了这种制度的问题，督抚在地方的权力过大，地方官员是难以抗衡的。
所以只能够从朝廷再度派出监察官员，加强对于地方官的监督，也就是所谓的巡按御史，洪武年间即有巡按御史之设，然非常例。至永乐元年二月乙卯，遣御史分巡天下，遂为定制。
朝廷认为，巡按御史品级很低，无法和督抚一样控制地方行政权力，同时可以作为朝廷的耳目，监察地方的动向，但是现在一样也出现了问题，就是巡按御史确实是可以对于地方府州县和三司官员形成强大的监督，但是对于督抚来说，巡按御史就不够看。
原因很简单，这些督抚自己就是高级言官，而巡按御史只不过是都察院的基层牛马，和这些高级言官相比自然是无法抗衡的，而且巡按御史的职权过重，敢于地方行政，也是一个极为要命的事情。
其实朱载坖很清楚其中的缘由，地方官总是要割据称雄的，于是不断派中央言官去分他们的权，形成了巡察之官架空常设之官的制度；人心莫测而必分其权，政出多门办不成事又不得不集中事权，形成了集权—分权往复循环之例。就是现在大明的这种情况的主要原因
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